С течением времени жизни дерева из-за условий, в которых оно растёт и развивается, образуются недостатки. Эти отклонения в строении и развитии ствола приводят к порокам, которые существенно ограничивают применение данного экземпляра в той или иной области строительства.

Различают следующие пороки: искривление ствола, сучки, наросты, развилки по всей длине. От этих недостатков изменяется структура и цвет древесины, а также снижается механическая прочность дерева и произведений из него, в том числе изделий погонажных.

По мере роста дерева на стволе проявляются трещины. Это происходит из-за внутреннего напряжения и других природных факторов. Трещины подразделяют на отлупные, метиковые и морозные.

Во время сильных морозов вследствии расширения внутренней влаги образуются морозные трещины. Обычно это направленные радиально сквозные трещины. Отлупные трещины (отслоение годичных слоёв друг от друга) образуются из-за внутреннего напряжения, которое возникает в стволе. По этой же причине появляются и метиковые трещины, они от комеля вдоль ствола поднимаются к верхушке. А во время сушки древесины образуются новые трещины и снижают качество пиломатериала.

Сучки также неблагоприятно отражаются на качестве древесины и производных из неё. Механическая прочность древесины существенно снижена в местах, где образованы сучки. Связь с основой у сучка ослабляется после сушки, поэтому конструкция может потерять крепость и стать уязвимой. Внешний вид изделия не слишком презентабельно смотрится при наличии сучков, особенно если отделка прозрачная. Это ещё один минус в применении сучковатых стволов.

Наклон волокон косослой указывает на отклонения от продольной оси дерева направления волокон. Поперечная нагрузка плохо воспринимается пиломатериалом, изготовленным из древесины, имеющей подобный порок. Разновидностью косослоя является свилеватость (волнистое волоконное расположение), а также завиток (когда годичные слои искривляются в одном месте).

На участке дерева из-за механических повреждений клетчатки образуется ещё один дефект – прорость. Внешний вид древесины в этом месте безнадёжно испорчен, к тому же обработка материала представляет собой усложнённый процесс. Засмолки и грибные пятна частые гости на таких участках древесины.

В результате воздействия на древесину процессов гниения возникают грибные поражения. Они влияют на цвет, изменяя его, а также подвергают материал неустойчивым механическим свойствам, заметно ухудшая их.